Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc113Q8C5T8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms