Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1Y8

Ccz1, Vacuolar fusion protein CCZ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccz1Q8C1Y8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccz1Q8C1Y8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccz1Q8C1Y8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccz1Q8C1Y8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccz1Q8C1Y8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccz1Q8C1Y8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccz1Q8C1Y8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccz1Q8C1Y8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccz1Q8C1Y8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccz1Q8C1Y8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccz1Q8C1Y8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms