Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1F4

Csgalnact2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csgalnact2Q8C1F4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csgalnact2Q8C1F4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms