Protein–RNA interactions for Protein: Q8C196

Cps1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cps1Q8C196 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cps1Q8C196 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cps1Q8C196 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cps1Q8C196 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cps1Q8C196 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cps1Q8C196 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cps1Q8C196 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Cps1Q8C196 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cps1Q8C196 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cps1Q8C196 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cps1Q8C196 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cps1Q8C196 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cps1Q8C196 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cps1Q8C196 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cps1Q8C196 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cps1Q8C196 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cps1Q8C196 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cps1Q8C196 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cps1Q8C196 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cps1Q8C196 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cps1Q8C196 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cps1Q8C196 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cps1Q8C196 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cps1Q8C196 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cps1Q8C196 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cps1Q8C196 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cps1Q8C196 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cps1Q8C196 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cps1Q8C196 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cps1Q8C196 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cps1Q8C196 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cps1Q8C196 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cps1Q8C196 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cps1Q8C196 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cps1Q8C196 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cps1Q8C196 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cps1Q8C196 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cps1Q8C196 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cps1Q8C196 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cps1Q8C196 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cps1Q8C196 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cps1Q8C196 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cps1Q8C196 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cps1Q8C196 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cps1Q8C196 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cps1Q8C196 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Cps1Q8C196 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cps1Q8C196 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Cps1Q8C196 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cps1Q8C196 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Cps1Q8C196 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cps1Q8C196 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28■■■□□ 2.07
Cps1Q8C196 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cps1Q8C196 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cps1Q8C196 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cps1Q8C196 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cps1Q8C196 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cps1Q8C196 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cps1Q8C196 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cps1Q8C196 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cps1Q8C196 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cps1Q8C196 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cps1Q8C196 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cps1Q8C196 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cps1Q8C196 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cps1Q8C196 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cps1Q8C196 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cps1Q8C196 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cps1Q8C196 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cps1Q8C196 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cps1Q8C196 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cps1Q8C196 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cps1Q8C196 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cps1Q8C196 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cps1Q8C196 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cps1Q8C196 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cps1Q8C196 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cps1Q8C196 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cps1Q8C196 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cps1Q8C196 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cps1Q8C196 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cps1Q8C196 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cps1Q8C196 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cps1Q8C196 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cps1Q8C196 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Cps1Q8C196 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cps1Q8C196 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cps1Q8C196 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cps1Q8C196 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cps1Q8C196 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cps1Q8C196 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cps1Q8C196 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cps1Q8C196 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cps1Q8C196 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cps1Q8C196 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cps1Q8C196 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cps1Q8C196 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cps1Q8C196 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cps1Q8C196 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cps1Q8C196 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms