Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R0

Usp37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp37Q8C0R0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp37Q8C0R0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp37Q8C0R0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp37Q8C0R0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp37Q8C0R0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp37Q8C0R0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp37Q8C0R0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp37Q8C0R0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp37Q8C0R0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp37Q8C0R0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp37Q8C0R0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp37Q8C0R0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp37Q8C0R0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp37Q8C0R0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp37Q8C0R0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp37Q8C0R0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp37Q8C0R0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp37Q8C0R0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp37Q8C0R0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp37Q8C0R0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp37Q8C0R0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp37Q8C0R0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp37Q8C0R0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp37Q8C0R0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp37Q8C0R0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp37Q8C0R0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp37Q8C0R0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp37Q8C0R0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp37Q8C0R0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp37Q8C0R0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp37Q8C0R0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Usp37Q8C0R0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp37Q8C0R0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp37Q8C0R0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp37Q8C0R0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp37Q8C0R0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp37Q8C0R0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp37Q8C0R0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp37Q8C0R0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp37Q8C0R0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp37Q8C0R0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp37Q8C0R0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp37Q8C0R0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp37Q8C0R0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp37Q8C0R0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp37Q8C0R0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp37Q8C0R0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp37Q8C0R0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp37Q8C0R0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp37Q8C0R0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp37Q8C0R0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp37Q8C0R0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 188.4 ms