Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccser1Q8C0C4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.1 ms