Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trerf1Q8BXJ2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trerf1Q8BXJ2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trerf1Q8BXJ2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trerf1Q8BXJ2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Trerf1Q8BXJ2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trerf1Q8BXJ2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trerf1Q8BXJ2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trerf1Q8BXJ2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trerf1Q8BXJ2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trerf1Q8BXJ2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trerf1Q8BXJ2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trerf1Q8BXJ2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trerf1Q8BXJ2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trerf1Q8BXJ2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trerf1Q8BXJ2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trerf1Q8BXJ2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trerf1Q8BXJ2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trerf1Q8BXJ2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trerf1Q8BXJ2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trerf1Q8BXJ2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trerf1Q8BXJ2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trerf1Q8BXJ2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trerf1Q8BXJ2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Trerf1Q8BXJ2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Trerf1Q8BXJ2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
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Trerf1Q8BXJ2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trerf1Q8BXJ2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trerf1Q8BXJ2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trerf1Q8BXJ2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trerf1Q8BXJ2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trerf1Q8BXJ2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Trerf1Q8BXJ2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trerf1Q8BXJ2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trerf1Q8BXJ2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trerf1Q8BXJ2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Trerf1Q8BXJ2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trerf1Q8BXJ2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trerf1Q8BXJ2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trerf1Q8BXJ2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Trerf1Q8BXJ2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trerf1Q8BXJ2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Trerf1Q8BXJ2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trerf1Q8BXJ2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trerf1Q8BXJ2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trerf1Q8BXJ2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trerf1Q8BXJ2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trerf1Q8BXJ2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trerf1Q8BXJ2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trerf1Q8BXJ2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trerf1Q8BXJ2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trerf1Q8BXJ2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Trerf1Q8BXJ2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trerf1Q8BXJ2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trerf1Q8BXJ2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trerf1Q8BXJ2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trerf1Q8BXJ2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trerf1Q8BXJ2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trerf1Q8BXJ2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trerf1Q8BXJ2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Trerf1Q8BXJ2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trerf1Q8BXJ2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trerf1Q8BXJ2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trerf1Q8BXJ2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trerf1Q8BXJ2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trerf1Q8BXJ2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trerf1Q8BXJ2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trerf1Q8BXJ2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trerf1Q8BXJ2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trerf1Q8BXJ2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trerf1Q8BXJ2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trerf1Q8BXJ2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trerf1Q8BXJ2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trerf1Q8BXJ2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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