Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snx17Q8BVL3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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