Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ssc5dQ8BV57 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
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