Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nup54Q8BTS4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms