Protein–RNA interactions for Protein: Q8BS47

9430097D07Rik, RIKEN cDNA 9430097D07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9430097D07RikQ8BS47 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
9430097D07RikQ8BS47 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9430097D07RikQ8BS47 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.5 ms