Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ08

5730596B20Rik, RIKEN cDNA 5730596B20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730596B20RikQ8BQ08 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms