Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gga3Q8BMI3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gga3Q8BMI3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms