Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

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Length 703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem260Q8BMD6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem260Q8BMD6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem260Q8BMD6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem260Q8BMD6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem260Q8BMD6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem260Q8BMD6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem260Q8BMD6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem260Q8BMD6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem260Q8BMD6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem260Q8BMD6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem260Q8BMD6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem260Q8BMD6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem260Q8BMD6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem260Q8BMD6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem260Q8BMD6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem260Q8BMD6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem260Q8BMD6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem260Q8BMD6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem260Q8BMD6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmem260Q8BMD6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmem260Q8BMD6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmem260Q8BMD6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmem260Q8BMD6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem260Q8BMD6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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