Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMA6

Srp68, Signal recognition particle subunit SRP68, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp68Q8BMA6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srp68Q8BMA6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srp68Q8BMA6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srp68Q8BMA6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srp68Q8BMA6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srp68Q8BMA6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srp68Q8BMA6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srp68Q8BMA6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srp68Q8BMA6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srp68Q8BMA6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srp68Q8BMA6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srp68Q8BMA6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srp68Q8BMA6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Srp68Q8BMA6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srp68Q8BMA6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srp68Q8BMA6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srp68Q8BMA6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srp68Q8BMA6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srp68Q8BMA6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srp68Q8BMA6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srp68Q8BMA6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srp68Q8BMA6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srp68Q8BMA6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srp68Q8BMA6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srp68Q8BMA6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srp68Q8BMA6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srp68Q8BMA6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Srp68Q8BMA6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Srp68Q8BMA6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Srp68Q8BMA6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Srp68Q8BMA6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Srp68Q8BMA6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Srp68Q8BMA6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Srp68Q8BMA6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Srp68Q8BMA6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Srp68Q8BMA6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Srp68Q8BMA6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Srp68Q8BMA6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Srp68Q8BMA6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Srp68Q8BMA6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Srp68Q8BMA6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Srp68Q8BMA6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Srp68Q8BMA6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Srp68Q8BMA6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Srp68Q8BMA6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Srp68Q8BMA6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Srp68Q8BMA6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Srp68Q8BMA6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Srp68Q8BMA6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Srp68Q8BMA6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Srp68Q8BMA6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Srp68Q8BMA6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Srp68Q8BMA6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Srp68Q8BMA6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Srp68Q8BMA6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Srp68Q8BMA6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Srp68Q8BMA6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Srp68Q8BMA6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Srp68Q8BMA6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Srp68Q8BMA6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Srp68Q8BMA6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Srp68Q8BMA6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Srp68Q8BMA6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Srp68Q8BMA6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Srp68Q8BMA6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Srp68Q8BMA6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Srp68Q8BMA6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Srp68Q8BMA6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Srp68Q8BMA6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Srp68Q8BMA6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Srp68Q8BMA6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Srp68Q8BMA6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Srp68Q8BMA6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Srp68Q8BMA6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Srp68Q8BMA6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Srp68Q8BMA6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Srp68Q8BMA6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Srp68Q8BMA6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Srp68Q8BMA6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Srp68Q8BMA6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Srp68Q8BMA6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Srp68Q8BMA6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Srp68Q8BMA6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Srp68Q8BMA6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Srp68Q8BMA6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Srp68Q8BMA6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Srp68Q8BMA6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Srp68Q8BMA6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Srp68Q8BMA6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Srp68Q8BMA6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Srp68Q8BMA6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Srp68Q8BMA6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Srp68Q8BMA6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Srp68Q8BMA6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Srp68Q8BMA6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Srp68Q8BMA6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Srp68Q8BMA6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Srp68Q8BMA6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Srp68Q8BMA6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Srp68Q8BMA6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms