Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpc2Q8BKV1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpc2Q8BKV1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpc2Q8BKV1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpc2Q8BKV1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpc2Q8BKV1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpc2Q8BKV1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpc2Q8BKV1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpc2Q8BKV1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpc2Q8BKV1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpc2Q8BKV1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpc2Q8BKV1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpc2Q8BKV1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpc2Q8BKV1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpc2Q8BKV1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpc2Q8BKV1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpc2Q8BKV1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpc2Q8BKV1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpc2Q8BKV1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpc2Q8BKV1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpc2Q8BKV1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpc2Q8BKV1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpc2Q8BKV1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpc2Q8BKV1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpc2Q8BKV1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpc2Q8BKV1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpc2Q8BKV1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpc2Q8BKV1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpc2Q8BKV1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpc2Q8BKV1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpc2Q8BKV1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpc2Q8BKV1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpc2Q8BKV1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpc2Q8BKV1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpc2Q8BKV1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpc2Q8BKV1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpc2Q8BKV1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpc2Q8BKV1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms