Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tspan12Q8BKT6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tspan12Q8BKT6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tspan12Q8BKT6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tspan12Q8BKT6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tspan12Q8BKT6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tspan12Q8BKT6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tspan12Q8BKT6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tspan12Q8BKT6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tspan12Q8BKT6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tspan12Q8BKT6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tspan12Q8BKT6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tspan12Q8BKT6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tspan12Q8BKT6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tspan12Q8BKT6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tspan12Q8BKT6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tspan12Q8BKT6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan12Q8BKT6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms