Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan9Q8BJU2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tspan9Q8BJU2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tspan9Q8BJU2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspan9Q8BJU2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspan9Q8BJU2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspan9Q8BJU2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspan9Q8BJU2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspan9Q8BJU2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspan9Q8BJU2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspan9Q8BJU2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspan9Q8BJU2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspan9Q8BJU2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspan9Q8BJU2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tspan9Q8BJU2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tspan9Q8BJU2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tspan9Q8BJU2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tspan9Q8BJU2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tspan9Q8BJU2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tspan9Q8BJU2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tspan9Q8BJU2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan9Q8BJU2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan9Q8BJU2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan9Q8BJU2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan9Q8BJU2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan9Q8BJU2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan9Q8BJU2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan9Q8BJU2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan9Q8BJU2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan9Q8BJU2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan9Q8BJU2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan9Q8BJU2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan9Q8BJU2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan9Q8BJU2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan9Q8BJU2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspan9Q8BJU2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspan9Q8BJU2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspan9Q8BJU2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms