Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIF2

Rbfox3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbfox3Q8BIF2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms