Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmco3Q8BH01 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmco3Q8BH01 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms