Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Vipas39Q8BGQ1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms