Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms