Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms