Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrfn4Q80XU8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lrfn4Q80XU8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lrfn4Q80XU8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrfn4Q80XU8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrfn4Q80XU8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrfn4Q80XU8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrfn4Q80XU8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrfn4Q80XU8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrfn4Q80XU8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrfn4Q80XU8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrfn4Q80XU8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrfn4Q80XU8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrfn4Q80XU8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrfn4Q80XU8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrfn4Q80XU8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrfn4Q80XU8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrfn4Q80XU8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrfn4Q80XU8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrfn4Q80XU8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrfn4Q80XU8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrfn4Q80XU8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrfn4Q80XU8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrfn4Q80XU8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrfn4Q80XU8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrfn4Q80XU8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrfn4Q80XU8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrfn4Q80XU8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms