Protein–RNA interactions for Protein: Q80W54

Zmpste24, CAAX prenyl protease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmpste24Q80W54 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zmpste24Q80W54 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zmpste24Q80W54 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zmpste24Q80W54 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zmpste24Q80W54 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zmpste24Q80W54 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zmpste24Q80W54 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zmpste24Q80W54 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zmpste24Q80W54 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zmpste24Q80W54 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zmpste24Q80W54 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zmpste24Q80W54 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zmpste24Q80W54 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zmpste24Q80W54 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zmpste24Q80W54 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zmpste24Q80W54 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zmpste24Q80W54 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zmpste24Q80W54 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zmpste24Q80W54 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zmpste24Q80W54 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zmpste24Q80W54 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zmpste24Q80W54 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zmpste24Q80W54 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zmpste24Q80W54 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Zmpste24Q80W54 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zmpste24Q80W54 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Zmpste24Q80W54 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zmpste24Q80W54 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zmpste24Q80W54 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zmpste24Q80W54 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zmpste24Q80W54 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zmpste24Q80W54 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zmpste24Q80W54 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zmpste24Q80W54 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zmpste24Q80W54 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zmpste24Q80W54 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zmpste24Q80W54 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zmpste24Q80W54 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zmpste24Q80W54 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zmpste24Q80W54 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zmpste24Q80W54 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zmpste24Q80W54 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zmpste24Q80W54 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zmpste24Q80W54 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zmpste24Q80W54 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zmpste24Q80W54 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zmpste24Q80W54 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zmpste24Q80W54 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zmpste24Q80W54 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms