Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ell3Q80VR2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms