Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpp38Q80UU2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpp38Q80UU2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpp38Q80UU2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpp38Q80UU2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpp38Q80UU2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpp38Q80UU2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpp38Q80UU2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpp38Q80UU2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpp38Q80UU2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpp38Q80UU2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpp38Q80UU2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpp38Q80UU2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpp38Q80UU2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpp38Q80UU2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpp38Q80UU2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rpp38Q80UU2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpp38Q80UU2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms