Protein–RNA interactions for Protein: Q80U62

Rubcn, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnQ80U62 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RubcnQ80U62 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RubcnQ80U62 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RubcnQ80U62 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RubcnQ80U62 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RubcnQ80U62 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RubcnQ80U62 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RubcnQ80U62 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RubcnQ80U62 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RubcnQ80U62 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RubcnQ80U62 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RubcnQ80U62 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RubcnQ80U62 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RubcnQ80U62 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RubcnQ80U62 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RubcnQ80U62 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RubcnQ80U62 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RubcnQ80U62 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RubcnQ80U62 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RubcnQ80U62 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RubcnQ80U62 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RubcnQ80U62 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RubcnQ80U62 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RubcnQ80U62 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RubcnQ80U62 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RubcnQ80U62 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RubcnQ80U62 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RubcnQ80U62 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RubcnQ80U62 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RubcnQ80U62 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RubcnQ80U62 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RubcnQ80U62 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RubcnQ80U62 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RubcnQ80U62 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RubcnQ80U62 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RubcnQ80U62 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RubcnQ80U62 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RubcnQ80U62 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RubcnQ80U62 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RubcnQ80U62 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RubcnQ80U62 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RubcnQ80U62 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RubcnQ80U62 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RubcnQ80U62 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RubcnQ80U62 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RubcnQ80U62 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RubcnQ80U62 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RubcnQ80U62 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RubcnQ80U62 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RubcnQ80U62 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RubcnQ80U62 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RubcnQ80U62 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RubcnQ80U62 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RubcnQ80U62 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RubcnQ80U62 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RubcnQ80U62 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RubcnQ80U62 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RubcnQ80U62 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RubcnQ80U62 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RubcnQ80U62 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RubcnQ80U62 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RubcnQ80U62 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RubcnQ80U62 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RubcnQ80U62 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RubcnQ80U62 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RubcnQ80U62 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RubcnQ80U62 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RubcnQ80U62 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RubcnQ80U62 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RubcnQ80U62 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RubcnQ80U62 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RubcnQ80U62 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RubcnQ80U62 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RubcnQ80U62 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RubcnQ80U62 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RubcnQ80U62 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RubcnQ80U62 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RubcnQ80U62 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RubcnQ80U62 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms