Protein–RNA interactions for Protein: Q80TQ2

Cyld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, mousemouse

Predictions only

Length 952 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CyldQ80TQ2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CyldQ80TQ2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CyldQ80TQ2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CyldQ80TQ2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CyldQ80TQ2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CyldQ80TQ2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CyldQ80TQ2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CyldQ80TQ2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms