Protein–RNA interactions for Protein: Q80T74

Klhl29, Kelch-like protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl29Q80T74 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl29Q80T74 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klhl29Q80T74 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhl29Q80T74 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhl29Q80T74 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhl29Q80T74 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhl29Q80T74 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhl29Q80T74 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhl29Q80T74 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhl29Q80T74 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhl29Q80T74 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhl29Q80T74 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klhl29Q80T74 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Klhl29Q80T74 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klhl29Q80T74 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klhl29Q80T74 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klhl29Q80T74 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klhl29Q80T74 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klhl29Q80T74 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klhl29Q80T74 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klhl29Q80T74 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klhl29Q80T74 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klhl29Q80T74 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klhl29Q80T74 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klhl29Q80T74 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klhl29Q80T74 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klhl29Q80T74 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms