Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSV6

Got1l1, Putative aspartate aminotransferase, cytoplasmic 2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Got1l1Q7TSV6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Got1l1Q7TSV6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Got1l1Q7TSV6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Got1l1Q7TSV6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Got1l1Q7TSV6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Got1l1Q7TSV6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Got1l1Q7TSV6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Got1l1Q7TSV6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Got1l1Q7TSV6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Got1l1Q7TSV6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Got1l1Q7TSV6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Got1l1Q7TSV6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Got1l1Q7TSV6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Got1l1Q7TSV6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Got1l1Q7TSV6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Got1l1Q7TSV6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Got1l1Q7TSV6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Got1l1Q7TSV6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Got1l1Q7TSV6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Got1l1Q7TSV6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Got1l1Q7TSV6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Got1l1Q7TSV6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Got1l1Q7TSV6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Got1l1Q7TSV6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Got1l1Q7TSV6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Got1l1Q7TSV6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Got1l1Q7TSV6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Got1l1Q7TSV6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Got1l1Q7TSV6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Got1l1Q7TSV6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Got1l1Q7TSV6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Got1l1Q7TSV6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Got1l1Q7TSV6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Got1l1Q7TSV6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Got1l1Q7TSV6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Got1l1Q7TSV6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Got1l1Q7TSV6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Got1l1Q7TSV6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Got1l1Q7TSV6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Got1l1Q7TSV6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Got1l1Q7TSV6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Got1l1Q7TSV6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Got1l1Q7TSV6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Got1l1Q7TSV6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms