Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ClmQ7TSN2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms