Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Dsg1bQ7TSF1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dsg1bQ7TSF1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dsg1bQ7TSF1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms