Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Prrc2bQ7TPM1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Prrc2bQ7TPM1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Prrc2bQ7TPM1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Prrc2bQ7TPM1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Prrc2bQ7TPM1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Prrc2bQ7TPM1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Prrc2bQ7TPM1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Prrc2bQ7TPM1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Prrc2bQ7TPM1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Prrc2bQ7TPM1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Prrc2bQ7TPM1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Prrc2bQ7TPM1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Prrc2bQ7TPM1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prrc2bQ7TPM1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prrc2bQ7TPM1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prrc2bQ7TPM1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prrc2bQ7TPM1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prrc2bQ7TPM1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prrc2bQ7TPM1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prrc2bQ7TPM1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prrc2bQ7TPM1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prrc2bQ7TPM1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prrc2bQ7TPM1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prrc2bQ7TPM1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prrc2bQ7TPM1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prrc2bQ7TPM1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Prrc2bQ7TPM1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Prrc2bQ7TPM1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Prrc2bQ7TPM1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Prrc2bQ7TPM1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Prrc2bQ7TPM1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Prrc2bQ7TPM1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Prrc2bQ7TPM1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Prrc2bQ7TPM1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Prrc2bQ7TPM1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Prrc2bQ7TPM1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Prrc2bQ7TPM1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Prrc2bQ7TPM1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Prrc2bQ7TPM1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Prrc2bQ7TPM1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Prrc2bQ7TPM1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Prrc2bQ7TPM1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Prrc2bQ7TPM1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Prrc2bQ7TPM1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Prrc2bQ7TPM1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Prrc2bQ7TPM1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Prrc2bQ7TPM1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Prrc2bQ7TPM1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prrc2bQ7TPM1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prrc2bQ7TPM1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prrc2bQ7TPM1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prrc2bQ7TPM1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prrc2bQ7TPM1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prrc2bQ7TPM1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prrc2bQ7TPM1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prrc2bQ7TPM1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prrc2bQ7TPM1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prrc2bQ7TPM1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Prrc2bQ7TPM1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Prrc2bQ7TPM1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Prrc2bQ7TPM1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Prrc2bQ7TPM1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Prrc2bQ7TPM1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Prrc2bQ7TPM1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Prrc2bQ7TPM1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Prrc2bQ7TPM1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Prrc2bQ7TPM1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Prrc2bQ7TPM1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Prrc2bQ7TPM1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Prrc2bQ7TPM1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Prrc2bQ7TPM1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Prrc2bQ7TPM1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Prrc2bQ7TPM1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Prrc2bQ7TPM1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Prrc2bQ7TPM1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Prrc2bQ7TPM1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Prrc2bQ7TPM1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Prrc2bQ7TPM1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prrc2bQ7TPM1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prrc2bQ7TPM1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prrc2bQ7TPM1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prrc2bQ7TPM1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prrc2bQ7TPM1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms