Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mycbp2Q7TPH6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mycbp2Q7TPH6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mycbp2Q7TPH6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mycbp2Q7TPH6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mycbp2Q7TPH6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Mycbp2Q7TPH6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mycbp2Q7TPH6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mycbp2Q7TPH6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mycbp2Q7TPH6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mycbp2Q7TPH6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mycbp2Q7TPH6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mycbp2Q7TPH6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Mycbp2Q7TPH6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms