Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPD6

Raver2, Ribonucleoprotein PTB-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raver2Q7TPD6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Raver2Q7TPD6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Raver2Q7TPD6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Raver2Q7TPD6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Raver2Q7TPD6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Raver2Q7TPD6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Raver2Q7TPD6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Raver2Q7TPD6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Raver2Q7TPD6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Raver2Q7TPD6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Raver2Q7TPD6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Raver2Q7TPD6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Raver2Q7TPD6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Raver2Q7TPD6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Raver2Q7TPD6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Raver2Q7TPD6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Raver2Q7TPD6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Raver2Q7TPD6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Raver2Q7TPD6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Raver2Q7TPD6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Raver2Q7TPD6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Raver2Q7TPD6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Raver2Q7TPD6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Raver2Q7TPD6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Raver2Q7TPD6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Raver2Q7TPD6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Raver2Q7TPD6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Raver2Q7TPD6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Raver2Q7TPD6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Raver2Q7TPD6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Raver2Q7TPD6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Raver2Q7TPD6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Raver2Q7TPD6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Raver2Q7TPD6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Raver2Q7TPD6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Raver2Q7TPD6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Raver2Q7TPD6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Raver2Q7TPD6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Raver2Q7TPD6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Raver2Q7TPD6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Raver2Q7TPD6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Raver2Q7TPD6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Raver2Q7TPD6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Raver2Q7TPD6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Raver2Q7TPD6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Raver2Q7TPD6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Raver2Q7TPD6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms