Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nphp3Q7TNH6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nphp3Q7TNH6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nphp3Q7TNH6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nphp3Q7TNH6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nphp3Q7TNH6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nphp3Q7TNH6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nphp3Q7TNH6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nphp3Q7TNH6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nphp3Q7TNH6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Nphp3Q7TNH6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nphp3Q7TNH6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nphp3Q7TNH6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nphp3Q7TNH6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
Nphp3Q7TNH6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nphp3Q7TNH6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms