Protein–RNA interactions for Protein: Q7TM95

Tigd3, Tigger transposable element-derived protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd3Q7TM95 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tigd3Q7TM95 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms