Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Eci3Q78JN3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms