Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nup188Q6ZQH8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nup188Q6ZQH8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nup188Q6ZQH8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nup188Q6ZQH8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nup188Q6ZQH8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nup188Q6ZQH8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nup188Q6ZQH8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup188Q6ZQH8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup188Q6ZQH8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup188Q6ZQH8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup188Q6ZQH8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup188Q6ZQH8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup188Q6ZQH8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup188Q6ZQH8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup188Q6ZQH8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup188Q6ZQH8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup188Q6ZQH8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup188Q6ZQH8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup188Q6ZQH8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup188Q6ZQH8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup188Q6ZQH8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup188Q6ZQH8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup188Q6ZQH8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup188Q6ZQH8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup188Q6ZQH8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup188Q6ZQH8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup188Q6ZQH8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup188Q6ZQH8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nup188Q6ZQH8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nup188Q6ZQH8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nup188Q6ZQH8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nup188Q6ZQH8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup188Q6ZQH8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup188Q6ZQH8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup188Q6ZQH8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup188Q6ZQH8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup188Q6ZQH8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup188Q6ZQH8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nup188Q6ZQH8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nup188Q6ZQH8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nup188Q6ZQH8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nup188Q6ZQH8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nup188Q6ZQH8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nup188Q6ZQH8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nup188Q6ZQH8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nup188Q6ZQH8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nup188Q6ZQH8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nup188Q6ZQH8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nup188Q6ZQH8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nup188Q6ZQH8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nup188Q6ZQH8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nup188Q6ZQH8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nup188Q6ZQH8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms