Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nemp1Q6ZQE4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nemp1Q6ZQE4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nemp1Q6ZQE4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nemp1Q6ZQE4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nemp1Q6ZQE4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nemp1Q6ZQE4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nemp1Q6ZQE4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nemp1Q6ZQE4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nemp1Q6ZQE4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nemp1Q6ZQE4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nemp1Q6ZQE4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nemp1Q6ZQE4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nemp1Q6ZQE4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nemp1Q6ZQE4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nemp1Q6ZQE4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nemp1Q6ZQE4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nemp1Q6ZQE4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nemp1Q6ZQE4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nemp1Q6ZQE4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nemp1Q6ZQE4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nemp1Q6ZQE4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nemp1Q6ZQE4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nemp1Q6ZQE4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nemp1Q6ZQE4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nemp1Q6ZQE4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nemp1Q6ZQE4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nemp1Q6ZQE4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nemp1Q6ZQE4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nemp1Q6ZQE4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nemp1Q6ZQE4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Nemp1Q6ZQE4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nemp1Q6ZQE4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nemp1Q6ZQE4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nemp1Q6ZQE4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nemp1Q6ZQE4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nemp1Q6ZQE4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nemp1Q6ZQE4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nemp1Q6ZQE4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nemp1Q6ZQE4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nemp1Q6ZQE4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nemp1Q6ZQE4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nemp1Q6ZQE4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nemp1Q6ZQE4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Nemp1Q6ZQE4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms