Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smpd4Q6ZPR5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Smpd4Q6ZPR5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms