Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR4

Kcnt1, Potassium channel subfamily T member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnt1Q6ZPR4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnt1Q6ZPR4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147 ms