Protein–RNA interactions for Protein: Q6W9L1

H2-M2, Histocompatibility 2, M region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M2Q6W9L1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M2Q6W9L1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
H2-M2Q6W9L1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M2Q6W9L1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M2Q6W9L1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M2Q6W9L1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M2Q6W9L1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M2Q6W9L1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M2Q6W9L1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M2Q6W9L1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M2Q6W9L1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M2Q6W9L1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M2Q6W9L1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M2Q6W9L1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M2Q6W9L1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M2Q6W9L1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M2Q6W9L1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M2Q6W9L1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M2Q6W9L1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M2Q6W9L1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M2Q6W9L1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M2Q6W9L1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M2Q6W9L1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M2Q6W9L1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M2Q6W9L1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M2Q6W9L1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M2Q6W9L1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M2Q6W9L1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M2Q6W9L1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M2Q6W9L1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M2Q6W9L1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M2Q6W9L1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M2Q6W9L1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M2Q6W9L1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M2Q6W9L1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M2Q6W9L1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms