Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd300ld3Q6SJQ5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd300ld3Q6SJQ5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd300ld3Q6SJQ5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd300ld3Q6SJQ5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd300ld3Q6SJQ5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd300ld3Q6SJQ5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd300ld3Q6SJQ5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd300ld3Q6SJQ5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd300ld3Q6SJQ5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd300ld3Q6SJQ5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd300ld3Q6SJQ5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd300ld3Q6SJQ5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd300ld3Q6SJQ5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd300ld3Q6SJQ5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd300ld3Q6SJQ5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd300ld3Q6SJQ5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd300ld3Q6SJQ5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd300ld3Q6SJQ5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cd300ld3Q6SJQ5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cd300ld3Q6SJQ5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms