Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms