Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc57Q6PHN1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc57Q6PHN1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms