Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF5

Bms1, BMS1 homolog, ribosome assembly protein (Yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bms1Q6PGF5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bms1Q6PGF5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bms1Q6PGF5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Bms1Q6PGF5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Bms1Q6PGF5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bms1Q6PGF5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Bms1Q6PGF5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bms1Q6PGF5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bms1Q6PGF5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bms1Q6PGF5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bms1Q6PGF5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bms1Q6PGF5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bms1Q6PGF5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bms1Q6PGF5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bms1Q6PGF5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bms1Q6PGF5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bms1Q6PGF5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bms1Q6PGF5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bms1Q6PGF5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bms1Q6PGF5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bms1Q6PGF5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bms1Q6PGF5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bms1Q6PGF5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bms1Q6PGF5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bms1Q6PGF5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bms1Q6PGF5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bms1Q6PGF5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bms1Q6PGF5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bms1Q6PGF5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bms1Q6PGF5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bms1Q6PGF5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bms1Q6PGF5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bms1Q6PGF5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bms1Q6PGF5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bms1Q6PGF5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bms1Q6PGF5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bms1Q6PGF5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bms1Q6PGF5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Bms1Q6PGF5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Bms1Q6PGF5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Bms1Q6PGF5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Bms1Q6PGF5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Bms1Q6PGF5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bms1Q6PGF5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bms1Q6PGF5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bms1Q6PGF5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bms1Q6PGF5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bms1Q6PGF5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bms1Q6PGF5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bms1Q6PGF5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms