Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGC7

Slc35e3, Solute carrier family 35 member E3, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc35e3Q6PGC7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc35e3Q6PGC7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc35e3Q6PGC7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc35e3Q6PGC7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc35e3Q6PGC7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc35e3Q6PGC7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc35e3Q6PGC7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc35e3Q6PGC7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc35e3Q6PGC7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc35e3Q6PGC7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc35e3Q6PGC7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc35e3Q6PGC7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc35e3Q6PGC7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc35e3Q6PGC7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc35e3Q6PGC7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc35e3Q6PGC7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc35e3Q6PGC7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc35e3Q6PGC7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc35e3Q6PGC7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc35e3Q6PGC7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc35e3Q6PGC7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc35e3Q6PGC7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc35e3Q6PGC7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc35e3Q6PGC7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc35e3Q6PGC7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc35e3Q6PGC7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc35e3Q6PGC7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc35e3Q6PGC7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms