Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup98Q6PFD9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nup98Q6PFD9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms